Varhany v kostele sv. Petra a Pavla v Podbořanech jsou dílem saských varhanářů bratří Tobiase a Christiana Dresselů a na kůr podbořanského kostela byly umístěny v roce 1750. V prosinci 1816 uskutečnil renovaci varhanář Johann Konstantin Müller z nepomyšlské varhanářské dílny. V roce 1867 postavil Johann Georg Sommer z Chebu nynější samostatný hrací stůl a dodal nové klávesnice. Další renovaci varhan uskutečnil kolem r. 1887 místní varhanář Ferdinand Langenauer a v r. 1949 zde pracoval Gerhard Schaller, tehdy varhanář v Chebu. Později byl připojen elektroventilátor. Jedná se o dvoumanuálový nástroj mechanické traktury s třinácti rejstříky. Rozsah klaviatur je chromaticky C–c3, pedál chromaticky C–h.
KK
SOUČASNÁ DISPOZICE VARHAN
I. Manuál
Principál 8′, Gamba 8′, Oktáva 4′ (štítek na manubriu Flöte 4′), Kvinta 2 2/3, Superoktáva 2′
II. Manuál
Kopula 8′, Salicionál 8′, Kopula 4′, Principál 2′, Kvinta 1 1/3, Mixtura 3x
Pedál
Subbas 16′, Principálbas 8′
Spojka manuálová a pedálová